Совместное воздействие персистирующих инфекций и генетических вариаций человека на C
BMC Medicine, том 20, Номер статьи: 416 (2022) Цитировать эту статью
1436 Доступов
1 Цитаты
7 Альтметрика
Подробности о метриках
Множественные человеческие патогены вызывают хронические, иногда пожизненные инфекции. Даже если они часто латентны, эти инфекции могут вызвать некоторую степень местного или системного иммунного ответа, что приводит к хроническому воспалению низкой степени тяжести. Остается неполным понимание потенциального вклада как персистирующих инфекций, так и генетических вариаций человека в хроническое вялотекущее воспаление. Мы искали потенциальные связи между серопозитивностью к 13 персистирующим патогенам и уровнями воспалительного биомаркера С-реактивного белка (СРБ) в плазме, используя данные, собранные в рамках Британского биобанка и исследования CoLaus|PsyCoLaus, двух крупных популяционных когорт. . Мы выполнили обратную пошаговую регрессию, начиная со следующих потенциальных предикторов: серостатус для каждого патогена, полигенный показатель риска для СРБ, а также демографические и клинические факторы, которые, как известно, связаны с СРБ. Мы обнаружили доказательства связи между серопозитивностью Chlamydia trachomatis (значение P = 5,04e - 3) и Helicobacter pylori (значение P = 8,63e - 4) и более высокими уровнями СРБ в плазме. Мы также обнаружили связь между нагрузкой патогенов и уровнями СРБ (значение P = 4,12e - 4). Эти результаты улучшают наше понимание взаимосвязи между персистирующими инфекциями и хроническим воспалением, важным фактором, определяющим долгосрочную заболеваемость у людей.
Отчеты экспертной оценки
Воспаление — это сложная и необходимая реакция иммунной системы на вредные раздражители, такие как повреждение тканей, инфекция или воздействие токсинов [1]. В острую фазу, характеризующуюся изменением кровотока и повышением проницаемости кровеносных сосудов, белки плазмы и лейкоциты мигрируют из кровообращения в очаг воспаления [2]. Эта немедленная защитная реакция обычно позволяет устранить первопричину повреждения клеток и восстановить гомеостаз. Однако, когда острая реакция не может устранить повреждение ткани, например, из-за длительного воздействия раздражителей, воспаление может перейти в хронический процесс [3]. Ряд распространенных заболеваний, по крайней мере частично, вызваны хроническим воспалением, включая ишемическую болезнь сердца, диабет 2 типа и некоторые виды рака [4]. Таким образом, хотя воспаление играет важную роль в защите человека от агрессии, оно также способствует патофизиологии множества заболеваний, имеющих важное значение для общественного здравоохранения.
Diagnostic tests are capable of detecting the presence and intensity of systemic inflammation [5]. The most commonly used inflammatory biomarker is the acute-phase reactant C-reactive protein (CRP). This ring-shaped protein is produced by hepatocytes upon stimulation by pro-inflammatory cytokines such as interleukin (IL)-1b, IL-6, and TNF-a. Although CRP is commonly used as a sensitive indicator of inflammation, the factors influencing its baseline plasma levels are only partially understood. Circulating amounts of CRP are positively associated with age, body mass index (BMI), and smoking and inversely with male sex and physical activity [6,7,8]. In addition, large-scale genomic analyses have found multiple associations with hs-CRP levels, mainly in the loci enriched in hepatic, immune, and metabolic pathways, such as CRP, LEPR, IL6R, GCKR, APOE, and HNF1A-AS1 [ 80 000 subjects identifies multiple loci for C-reactive protein levels. Circulation. 2011;123(7):731–8." href="#ref-CR9" id="ref-link-section-d279472268e546">9, 200,000 individuals identify 58 loci for chronic inflammation and highlight pathways that link inflammation and complex disorders. Am J Human Genet. 2018;103(5):691–706." href="#ref-CR10" id="ref-link-section-d279472268e546_1"> 10,11,12,13,14]. В общей сложности генетическая изменчивость объясняет до 16% различий в уровнях СРБ в плазме [14].
We carried out a polygenic risk score (PRS) analysis to investigate the relationship between human genetic variation and hs-CRP levels. A CRP-PRS was calculated for each study participant based on the risk effects of common SNPs derived from GWAS summary statistics of hs-CRP. As a baseline cohort, we referred to the GWAS summary statistics of the CHARGE cohort (N = 204,402, heritability h2 = 6.5%) [ 200,000 individuals identify 58 loci for chronic inflammation and highlight pathways that link inflammation and complex disorders. Am J Human Genet. 2018;103(5):691–706." href="/articles/10.1186/s12916-022-02607-7#ref-CR10" id="ref-link-section-d279472268e675"10, 27]. These summary statistics were used to construct the CRP-PRS in our target cohort consisting of the merged UK Biobank and CoLaus|PsyCoLaus data using the clumping and thresholding method of the PRSice-2 v2.2.7 software [28]. We used a standardized method to obtain PRS, by multiplying the dosage of risk alleles for each variant by the effect size in the GWAS and summing the scores across all of the selected variants. SNPs were clumped based on linkage disequilibrium (LD) (r2 ≥ 0.1) within a 250-kb window. Model estimates of the PRS effect were adjusted for sex, age, BMI, and the top 10 PCs. As an additional quality control, the distribution of PRS was checked in each cohort separately, to ensure that they followed a normal distribution./p> We first investigated the relationship between common genetic variation and hs-CRP levels by calculating a PRS for all study participants. The PRS explained about 4% of the variation in hs-CRP levels, in agreement with previously published results [ 80 000 subjects identifies multiple loci for C-reactive protein levels. Circulation. 2011;123(7):731–8." href="/articles/10.1186/s12916-022-02607-7#ref-CR9" id="ref-link-section-d279472268e1261"9]. We also found that BMI was the major non-genetic predictor of hs-CRP, with approximately 19% of the variance explained./p>